Gå til innhold

Anbefalte innlegg

Videoannonse
Annonse

Hva i all verden er WU?

Ser dette er nevt mye, men ikke hva det er :p

WU er en forkortelse for "work unit", også omtalt som "arbeidsenhet". Ved simulering av proteinbretting må det gjøres matematiske utregninger på en stor mengde data. I F@Hs tilfelle benyttes en metode kalt "distribuert databehandling", der man splitter opp informasjonen som behandles i mange biter (i dette tilfellet "work units") og sender disse ut til et nettverk av maskiner som står klar til å prosessere dem. Hver klient i F@H-nettveret mottar en "work unit", prosesserer denne og sender det ferdige resultatet tilbake, deretter gjentas denne syklusen helt til alle arbeidsenhetene for et gitt prosjekt har blitt prosessert. Endret av fargoth
Lenke til kommentar

Takk for hjelpen ei57!

 

Hurra, da vet jeg at endelig fungerer SMP og core a2 under Ubuntu Linux. Trodde i flere dager (siden den 16) at feilen lå hos meg siden det aldri ble lastet ned noen WU. Men i dag kom endelig den første ned og gikk til 100%. Deretter er det samme historien igjen, med at "klarer ikke å få kontakt med workserver". Det er tydelig at Stanford har problemer med å dele ut nok WUer. Den WUen jeg fikk ga over 3K poeng så det lønner seg godt i forhold til de standard vanlige jobbene. I Windows fungerer alt normalt.

 

Er det forskjell på tildelingen av WUer for Linux og Windows?

Lenke til kommentar

Er det forskjell på tildelingen av WUer for Linux og Windows?

nei WUene er de samme. Det er kunn programmet og kjerne-programmene som er forskjellig.

 

Men hva slags instillinger satte du? Valgte du ja for advanced methods? Og hvor mye RAM tillater du FaH å bruke? Det er mulig du har begrenset hvilke WUer du ønsker å motta. Hvis dette kombineres med at Stanford har problemer med de WUserverene som du har begrenset deg til så blir det tørt.

 

Legg ut et utklipp av loggen rett etter oppstart av programmet:

 

på kommandolinja gjør følgende:

 

/etc/init.d/folding stop

 

/etc/init.d/fodling start

 

gedit ~/foldingathome/FAHLog.txt

 

 

copy-paste det som er helt på sluten av fila, fra oppstart av programmet. Denne delen av loggen vil fortelle alt om hva du ønsker å motta fra WU-serveren.

Lenke til kommentar

Xell

Vel, her er utklippet, synes ikke det sier noe unormalt. Klokka er 2 timer bak lokal tid så klippet er tatt 21.09:

 

 

--- Opening Log file [April 21 19:09:12] 


# SMP Client ##################################################################
###############################################################################

	Folding@Home Client Version 6.02

	[url="http://folding.stanford.edu"]http://folding.stanford.edu[/url]

###############################################################################
###############################################################################

Launch directory: /home/vidar/foldingathome/CPU1
Executable: /home/vidar/foldingathome/CPU1/fah6
Arguments: -smp 

[19:09:12] - Ask before connecting: No
[19:09:12] - User name: -alias- (Team 37651)
[19:09:12] - User ID: 158A70ED4B971BCF
[19:09:12] - Machine ID: 1
[19:09:12] 
[19:09:12] Loaded queue successfully.
[19:09:12] - Preparing to get new work unit...
[19:09:12] + Attempting to get work packet
[19:09:12] - Connecting to assignment server
[19:09:13] + No appropriate work server was available; will try again in a bit.
[19:09:13] + Couldn't get work instructions.
[19:09:13] - Attempt #1 to get work failed, and no other work to do.
	Waiting before retry.

Den har altså fullført en WU 1 gang. Her er klippet fra starten på den så kan du jo sammenligne:

--- Opening Log file [April 19 10:28:04] 


# SMP Client ##################################################################
###############################################################################

	Folding@Home Client Version 6.02

	[url="http://folding.stanford.edu"]http://folding.stanford.edu[/url]

###############################################################################
###############################################################################

Launch directory: /home/vidar/foldingathome/CPU1
Executable: /home/vidar/foldingathome/CPU1/fah6
Arguments: -smp 

[10:28:04] - Ask before connecting: No
[10:28:04] - User name: -alias- (Team 37651)
[10:28:04] - User ID: 158A70ED4B971BCF
[10:28:04] - Machine ID: 1
[10:28:04] 
[10:28:04] Loaded queue successfully.
[10:28:04] - Preparing to get new work unit...
[10:28:04] + Attempting to get work packet
[10:28:04] - Connecting to assignment server
[10:28:05] + No appropriate work server was available; will try again in a bit.
[10:28:05] + Couldn't get work instructions.
[10:28:05] - Attempt #1 to get work failed, and no other work to do.
	Waiting before retry.
[08:37:07] + Attempting to get work packet
[08:37:07] - Connecting to assignment server
[08:37:09] + No appropriate work server was available; will try again in a bit.
[08:37:09] + Couldn't get work instructions.
[08:37:09] - Attempt #24 to get work failed, and no other work to do.
	Waiting before retry.
[09:25:19] + Attempting to get work packet
[09:25:19] - Connecting to assignment server
[09:25:20] - Successful: assigned to (171.64.65.56).
[09:25:20] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[09:25:20] Loaded queue successfully.
[09:25:41] + Closed connections
[09:25:46] 
[09:25:46] + Processing work unit
[09:25:46] Core required: FahCore_a2.exe
[09:25:46] Core not found.
[09:25:46] - Core is not present or corrupted.
[09:25:46] - Attempting to download new core...
[09:25:46] + Downloading new core: FahCore_a2.exe
[09:25:47] + 10240 bytes downloaded
klippet bort her
[09:25:52] + 2406400 bytes downloaded
[09:25:52] + 2412195 bytes downloaded
[09:25:52] Verifying core Core_a2.fah...
[09:25:52] Signature is VALID
[09:25:52] 
[09:25:52] Trying to unzip core FahCore_a2.exe
[09:25:53] Decompressed FahCore_a2.exe (5509624 bytes) successfully
[09:25:53] + Core successfully engaged
[09:26:16] 
[09:26:16] + Processing work unit
[09:26:16] Core required: FahCore_a2.exe
[09:26:16] Core found.
[09:26:16] Working on Unit 08 [April 20 09:26:16]
[09:26:16] + Working ...
[09:26:16] 
[09:26:16] *------------------------------*
[09:26:16] Folding@Home Gromacs SMP Core
[09:26:16] Version 2.10 (Sun Aug 30 03:43:28 CEST 2009)
[09:26:16] 
[09:26:16] Preparing to commence simulation
[09:26:16] - Ensuring status. Please wait.
[09:26:25] - Looking at optimizations...
[09:26:25] - Working with standard loops on this execution.
[09:26:25] - Files status OK
[09:26:26] - Expanded 4839958 -> 23985345 (decompressed 495.5 percent)
[09:26:26] Called DecompressByteArray: compressed_data_size=4839958 data_size=23985345, decompressed_data_size=23985345 diff=0
[09:26:26] - Digital signature verified
[09:26:26] 
[09:26:26] Project: 2669 (Run 17, Clone 100, Gen 183)
[09:26:26] 
[09:26:26] Entering M.D.
[09:26:35] Completed 0 out of 250000 steps (0%)
[09:32:58] Completed 2500 out of 250000 steps (1%)
Klippet
[20:03:16] Completed 250000 out of 250000 steps (100%)
[20:03:17] DynamicWrapper: Finished Work Unit: sleep=10000
[20:03:27] 
[20:03:27] Finished Work Unit:
[20:03:27] - Reading up to 21130704 from "work/wudata_08.trr": Read 21130704
[20:03:27] trr file hash check passed.
[20:03:27] - Reading up to 4513688 from "work/wudata_08.xtc": Read 4513688
[20:03:27] xtc file hash check passed.
[20:03:27] edr file hash check passed.
[20:03:27] logfile size: 185727
[20:03:27] Leaving Run
[20:03:31] - Writing 25979903 bytes of core data to disk...
[20:03:32] ... Done.
[20:10:46] - Shutting down core
[20:10:46] 
[20:10:46] Folding@home Core Shutdown: FINISHED_UNIT
[20:11:15] CoreStatus = 64 (100)
[20:11:15] Sending work to server
[20:11:15] + Attempting to send results
[20:13:32] + Results successfully sent
[20:13:32] Thank you for your contribution to Folding@Home.

 

Klipp slutt

 

 

Ellers så har jeg bygget meg en ny i7-basert foldingrigg i dag og kjørt i gang en bigadv nr. 2 + fire stk. gpu-klienter.

Endret av -alias-
Lenke til kommentar

Ordlisten har vært i førstepost siden jeg tok over vedlikeholdet av den 9/12-09. Det som derimot er synd er at forumoppgraderingen har ødelagt tonnevis av informasjon i førstepost.

 

Jeg skal forsøke å finne energi til å få alt tilbake. Alt av spoilere, mouse-overs etc. er gone. Ordlisten var mouse-over basert.

 

Jeg har muligens lagret en tekstfil av førsteposten som jeg brukte for å editere den raskere, skal se om jeg finner den. (har dog reinstallert maskinen den lå på).

 

EDIT:

Det ser jaggu meg ut som drift har klart å rydde opp i spoilers og annet som ikke virket etter forumoppgraderingen! Ordlisten faktisk virker igjen! Så ja det ligger der Xell.

 

EDIT2:

Jeg fant også tekstfilen i en backup så da legger jeg inn linux tingene dine Xell.

 

EDIT3:

Dette nye forumet er helt på bærtur. En redigering med samme koder som drift hadde lagt inn og fikset og en haug spoilere slutter å virke igjen. Møkkaforum!

Endret av Theo343
Lenke til kommentar

Liker heller ikke helt den nye oppdateringen. Å klippe å lime fra nettsider som sitat er ikke like enkelt lenger. Før kunne man bare skrive quote= så viste sistatrammen det som sto etter =, men nå har de lagt til masse snæssne funksjoner i quote det bare ser dumt ut når man skriver det slikt. Noe som har ført til at jeg nesten har sluttet å henvise til hvor sitatet kommer fra. Funker sikkert greit hvia man kun bruker quote til å referere til forumposter, men jeg føler de fjærner mer enn de har lagt til her.

Lenke til kommentar

Jeg ser tonnevis av flere ulemper enn fordeler med denne forumoppgraderingen og det fikk meg til å tenke på å legge inn årene i forumet.

 

En annen ting de har latt seile inn i stillheten er at forumet har blitt smalere og ikke lenger er dynamisk. Dette jobbet de intenst med i starten (fulgte med i diskusjonene deres på IRC kanalen) men har tydeligvis gitt opp og håper vel at ingen klager mer på det.

 

Jeg forstår meg ikke på folk som alltid skal ha det nyeste uten å utrede konsekvenser først.

Endret av Theo343
Lenke til kommentar

Jeg tror dette med dynamisk er avhengig av hvilken layout du velger. Slik er det alltid ved forumoppdateringer. Jeg bruker Hardware.no Dynamisk og den funker som dena lltid har gjort; er dynamisk og bruker hele bredden av nettleseren.

 

Det som irriterer med mest med disse oppdateringe som kommer gjevnt og trutt ( og litt for ofte) er at de fleste av de feilene man har i begynnelsen trenger man ikke tilbakemelding fra brukere for å oppdage; med andre ord; de skulle vært luket vekk før endringen ble rullet ut.

 

Gud hvor jeg savner det gode gamle frames-forumet. Det hadde ikke mye fancy features, men det funket i alle fall. En ting som de enda ikke har fått på plass til tross for at det har blitt etterlyst ved hver eneste forumoppdatering de siste årene, er en måte for den enkelte bruker å redusere forumet til det som er av interresse. Jeg var ivrig bruker av ubesvarte poster før, men nå er det håpløs å bruke for forumet har blitt så stort at de postene jeg kunne ha bidratt i drukner i mengden av kategorier som intresserer meg midt i rævva. Det er rett og slett for mye jobb å finne fram i mengden av alt som gjør at jeg er mindere aktiv en det jeg var før. Men det er vel viktigere å skryte av stort forum med mange brukere enn at det skal være noe kvalitet lenger.

Endret av Xell
Lenke til kommentar

Jeg tror dette med dynamisk er avhengig av hvilken layout du velger. Slik er det alltid ved forumoppdateringer. Jeg bruker Hardware.no Dynamisk og den funker som dena lltid har gjort; er dynamisk og bruker hele bredden av nettleseren.

Jeg trodde også det men har ikke funnet noe slikt. Hvor er den?

 

 

Det som irriterer med mest med disse oppdateringe som kommer gjevnt og trutt ( og litt for ofte) er at de fleste av de feilene man har i begynnelsen trenger man ikke tilbakemelding fra brukere for å oppdage; med andre ord; de skulle vært luket vekk før endringen ble rullet ut.
Jepp, som jeg også sier.
Jeg forstår meg ikke på folk som alltid skal ha det nyeste uten å utrede konsekvenser først.
Og som du tillegger, her overlater de alt ansvar til brukerne selv om det er selvfølgelige ting de burde løst i forkant. Mao. hvis ikke mange nok klager gjør vi ikke noe med det og vil lar feil vi kjenner til være opp til brukerne å rapportere og purre på.

 

Men det er vel viktigere å skryte av stort forum med mange brukere enn at det skal være noe kvalitet lenger.
Fullstendig enig i at kvaliteten har falt drastisk de siste 2 år og vært årsak til revurdering av deltakelse eller ei opptil flere ganger. Men et fåtall (dvs. titalls) meget kvalitative brukere holder meg her.

 

 

Ang. folding:

Jeg driver å ser på å sette opp en foldingmaskin, så jeg har ikke gitt meg helt der Xell hehe.

Endret av Theo343
Lenke til kommentar

Se helt nederst på siden, theo. Der har du rullgardin for layout og språk (som kun kan velges Norsk :dontgetit: ). Mange av Layoutene er merket dynamis, men vet ikke hvem av dem som funker eller ikke. Hardware.no dynamisk funker i alle fall.

 

Denne instillingen lå også under profilen før, men nå finner jeg den ikke.

 

Oppdaget akkurat at de har slettet signaturen min!!!!! Rakkern heller. Mener å huske at de hadde gjort det sist gang også. Og sannelig hadde ikke profilen min blitt endret fra female til male på ett eller annet tidspunkt også. Jeg var ikke klar over at jeg hadde tatt kjønnsopperasjon. Kjekt å vite.

 

Flott at du ikke har gitt deg. Jeg har dabbet av mye i det siste, men det er fordi grom-maskina har vært mye i bruk til annet rart så jeg valgte å slå av FaH en stund i stede for alt slulle stå i sju steiner hele tida. Forhåpentlig vis får jeg startet opp i gjenn i løpet av neste uke.

Lenke til kommentar

Lenge siden jeg har foldet nå, men jeg har en server stående 24/7, som kunne gjort noe fornufitg. En eller annen kjip c2d exxx-prosessor, men likevel. I og med at den går hele tiden og står i stua, vil jeg helst ikke ha for mye viftestøy fra den. Får se om jeg får satt på en annen vifte jeg har liggende etter hvert, men inntil da vil jeg ikke kjøre cpu-en for mye. Er det greit nok å kun kjøre f@h opp til ca 50% av cpu? Er det en innstilling for det? Skal kjøres under FreeBSD, om det har noe å si.

Lenke til kommentar

Det går helt fint å kjøre på redusert prosessorytelse. Når man går gjennom konfigurasjonen så får man spørsmål om "CPU usage requested (5-100) [100]?" Default er altså 100% men man kan sette den så lavt som 5%. Det eneste du må passe på er at du ikke setter den så lavt at den ikke møter tidsfristene. Du kan jo prøve deg fram med å senke den litt og litt til du er fornøyd med viftestøyen.

Lenke til kommentar

Opprett en konto eller logg inn for å kommentere

Du må være et medlem for å kunne skrive en kommentar

Opprett konto

Det er enkelt å melde seg inn for å starte en ny konto!

Start en konto

Logg inn

Har du allerede en konto? Logg inn her.

Logg inn nå
  • Hvem er aktive   0 medlemmer

    • Ingen innloggede medlemmer aktive
×
×
  • Opprett ny...