Aminosyresekvens - Nettoladning, pI og pH

[ATI vs GeForce]

Oppgaven lyder som følger:

"Du har fått en løsning som inneholder de følgende tre peptidene A-C:

Peptid A: Asp-Asn-Gln

Peptid B: Val-Arg-Lys

Peptid C: Gly-Lys-Glu

 

Hva er nettoladningen til hvert peptid ved henholdsvis pH 1 og pH 7?"

 

Ved pH 1 er det mye H+ ioner i løsningen og ved pH 7 er det ca like mye H+ som OH- ioner. La oss se på Peptid A. Aspartat har en negativ ladd R-gruppe som jeg ville tro skulle nøytraliserers ved pH 1, siden H+ ionet binder seg til COO- gruppen. Amin gruppen vil jeg tro skal være positivt ladd ved pH 1, altså NH3+. Karboksylsyre-gruppen i Aspartat er vel bundet i peptidet og har ingen ladning(???), det samme med Aspargin. På enden er Glutamin, og siden amin-gruppen er bundet til Aspargin må det være karboksylsyre-gruppen på enden av peptidet jeg må se på. Siden pH er lav, masse H+ ioner, vil karboksylsyre-gruppen ikke ha noen ladning. Dermed er det bare Amin-gruppen i Aspartat som har en pluss ladning, ergo vil nettoladning være +1 .......... Eller???

 

Hva skjer da på pH 7? Beklager om det kan være mye å fordøye med dette er ekstremt eksamensrelevant i Bio-1001 på UiT...