Opphenting av gamle apps vil Google Play stå for, da selvsagt ikke med alt app-data du har liggende på telefonen.
Du bør egentlig ikke flytte over app-data da du går ifra 4.3 til 4.4, en grobunn for alle problemer for force-closed apper.
Misting av root skal du egentlig ikke gjøre men du kan være uheldig, sørg for at du har en oppdatert su.zip tilgjengelig og får du problemer så flasher du su.zip via TWRP. En oppdatering av TWRP kan være greit for å hindre problemer med flashingen.
Er det noen konkret grunn til at du benytter deg av denne ROM'en egentlig?
b-real's innlegg in [Løst] S4 Google Edition, spørsmål om flashing. ble markert som svaret